Depuis 2004, Danone Research mène de nouveaux projets de recherche avec l'Institut Pasteur de Paris, afin d'étudier les mécanismes d'action des ferments en interaction avec la flore intestinale dans trois domaines liés au fonctionnement du système immunitaire : la résistance aux infections virales et bactériennes, la prévention des allergies et les modulations de l'inflammation. Autant de connaissances mises ensuite au service de l’innovation.
Actimel, depuis 2007 est un partenaire privilégié du Pasteurdon, évènement annuel de sensibilisation et d’appels aux dons pour soutenir la recherche.